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ZhengGang
2018-12-19

Materials Studio 任务提交脚本详解

Materials Studio是美国Accelrys公司生产的新一代材料计算软件,它是商业软件哦。

在天河系统上如果用户希望使用它,请安装使用正版软件。

结合slurm的作业管理系统,可以使用我们编写的 ms-th-1A.sh 脚本提交任务。

这个脚本的使用方法为:

yhbatch -N NNODES -n NPROCS -p PARTITION ms-th-1A.sh server seedname         
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参数说明:

参数 含义
NNODES 使用的节点数
NPROCES 使用的总核数
PARTITION 计算分区铭(可以用 yhi 命令查看
server 模块名称,如castep, dmol or dftb
seedname xxx.param 前面的xxx,不需要加后缀

举一个例子,如果希望用 2 个节点,24 个CPU核心,TH_SR1 分区,使用castep 模块,计算输入文件为 Al.param 的任务,可以使用如下命令:

yhbatch -N 2 -n 24 -p TH_SR1 ms-th-1A.sh castep Al     
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当你忘了这个脚本怎么用的时候,可以:

chmod +x ./ms-th-1A.sh
./ms-th-1A.sh
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就会显示一下内容:

yhbatch -N NNODES -n NPROCS -p PARTITION ms-th-1A.sh server seedname         
                                                                             
    NNODES    :  number of nodes on which to run                             
    NPROCES   :  number of tasks to run                                      
    PARTITION :  partition requested (use 'yhi' to check available partition)
                                                                             
    server    :  server name (castep, dmol or dftb)                          
    seedname  :  seed name                                                   
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